Shannon、simpson和chao1指数
http://www.tinygene.com/statistic-analysis/biodiversity-index-01 Webb结果表明:①苯并噻唑硫酮灌根40 d后烟株无明显青枯病症状,而对照灭菌蒸馏水灌根40 d后烟株均枯萎死亡。②苯并噻唑硫酮灌根处理后,烟株根围细菌Alpha多样性指数中Sobs指数、Chao1指数以及香农指数(Shannon)升高。
Shannon、simpson和chao1指数
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Webb9 feb. 2024 · 再利用QIIME 1.8.0软件进行alpha多样性指数分析,包括测序深度指数 (goods-coverage index)、菌种丰富度指数 (Chao1 index)、谱系多样性指数 (PD-whole-tree index)、香农指数 (Shannon index)、辛普森多样性指数 (Simpson index)等。 基于物种注释及相对丰度结果,使用R 3.6.0软件进行物种组成柱状图分析。 使用R语言工具进行主成分分析 … http://www.desert.ac.cn/article/2024/1000-694X/1000-694X-2024-43-2-195.shtml
http://muchong.com/t-10922745-1-pid-2 Webb23 feb. 2024 · 表3 alpha多样性指数Tab.3 alpha Diversity index . Chao1指数和 Shannon指数反映了微生物群落的丰富度和多样性,数值越大说明群落丰富度和多样性越高; Simpson 指数反映了微生物群落的均匀性,数值越小,说明群落分布越均匀。
Webb1 aug. 2024 · Richness, Chao1,Shannon三个指数是常用的评估丰富度的指标,数值越高表明样品包含的物种丰富度就越高。 Richness指数: 指样本中被检测到的OTU量; … Webb这两个有细微的区别,辛普森多样性指数更加关注相对丰度 (relative abundance),而香农指数更侧重于物种丰富度 (species richness) 如果你的几个样本里面不同物种的丰度有明 …
Webb红芪多糖-1-1的分离纯化及其调节抗生素诱导小鼠肠道菌群失调的最佳剂量分析.docx
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